La compañía privada de aviación Grupo TACA es la más importante del país y tiene un gran número de vuelos a nivel regional (página web: www.grupotaca.com). Iberia, American Airlines y United Airlines vuelan con cierta regularidad a El Salvador.

De Madrid a San Salvador: 14.15 horas. De Buenos Aires a San Salvador (vía Miami): 10.50 horas. De México DF a San Salvador: 2.20 horas (con escala técnica en Ciudad de Guatemala). De Miami a San Salvador: 2 horas. De Nueva York a San Salvador (vía Miami): 5 horas.

San Salvador (SAL) (El Salvador Internacional) está situado a62 km. de la capital (duración del trayecto: 30 minutos). Hay un servicio de autobuses entre la ciudad y el aeropuerto (de 06.00 a 19.00). El aeropuerto cuenta además con parada de taxis, restaurante (de 06.00 a 19.00), tiendas libres de impuestos (de 06.00 a 20.00), alquiler de coches, banco, oficina de cambio de divisas (de 07.00 a 19.00) y consigna (de 06.00 a 22.00).

Tasa de salida: 22,80 euros (27 $ EE UU), incluida la Tasa de Inmigración de 2,40 euros (2,65 $ EE UU). Los niños menores de dos años están exentos de pagar la tasa de salida pero sí tienen que pagar la tasa de inmigración.

Los principales puertos son La Unión, La Libertad y Acajutla, ubicados en la costa del Pacífico.

Actualmente no existen conexiones ferroviarias por tren con Guatemala.

Hay compañías de autobuses que tienen rutas desde San Salvador a Ciudad de Guatemala. Si se llega a la frontera fuera de las horas normales de oficina (de 12.00 a 14.00 y de 18.00 a 08.00 de lunes a viernes; y de 12.00 del sábado a 08.00 del lunes) se deberá pagar una tasa para cruzar la frontera.