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Por aire
Las tres líneas aereas nacionales (Isleña Airlines, Sosa Airlines y Rollins Air) realizan vuelos diarios uniendo Tegucigalpa con las principales ciudades de Honduras. Isleña Airlines y Sosa Airlines vuelan a Utila, el destino turístico más accesible de las Islas de la Bahía (enfrente de la costa caribeña). Aparte de Tegucigalpa, los principales aeropuertos del país son Dr Ramón Villeda Morales, a 17 km. del centro de San Pedro Sula, y el aeropuerto de La Ceiba. Además hay unos 30 aeródromos para avionetas y pequeños aviones comerciales. Impuesto de salida: 1,30$ para los viajes internos.
Por mar: Hay transbordadores que operan tanto en la costa del Atlántico, como en la del Pacífico y en la del Caribe. Para más detalles contactar con las autoridades portuarias. Hay barcos que cubren la ruta varias veces a la semana desde La Ceiba y Puerto Cortés a las Islas de la Bahía. Se debe negociar con los dueños de las embarcaciones.
Ferrocarril: Sólo hay tres líneas ferroviarias, todas en la costa norte y usadas fundamentalmente para el transporte entre las plantaciones bananeras. Los turistas pueden realizar una excursión desde San Pedro Sula en un tren bananero, y desde La Ceiba en un tren turístico.
Por carretera: Se conduce por la derecha. Hay un total de 14.600 km. de red viaria, de los cuales 2.543 km. están pavimentados y 8.364 km están preparados para poder utilizarse en todas las épocas del año (tanto en las estaciones de lluvias como en las de sequía). Una de estás carreteras que se puede usar durante todo el año es la que va desde Tegucigalpa a San Pedro Sula, Puerto Cortés, La Ceiba, a las ciudades de la costa caribeña (en el norte) y a las del Golfo de Fonseca, (en el sur). Sin embargo, para los viajes de negocios es mucho más conveniente el transporte aéreo. Autobuses: Hay un servicio regular de autobuses entre las principales ciudades del país. Conviene reservar plaza con antelación. En general los autobuses son muy baratos.
Taxi: No disponen de taxímetro y dentro de las ciudades funcionan con una tarifa fija. Para otro tipo de trayectos debe negociarse el precio antes de iniciar el viaje. Alquiler de coches: Se pueden alquilar coches en los aeropuertos y en las principales ciudades en compañías como Avis, Hertz, Interamericana, Maya o Molinari, entre otras. Documentation: Se aceptan tanto los carnets de conducir emitidos en países extranjeros, como el permiso de conducir internacional.
Duración de los trayectos: La siguiente tabla muestra el tiempo aproximado de viaje (en horas y minutos) desde Tegucigalpa a las principales ciudades de Honduras.
| Por aire | Por carretera | |
| Comayagua | - | 1.00 |
| Siguatepeque | - | 2.30 |
| San Pedro S. | 0.25 | 3.30 |
| Choluteca | - | 2.30 |
| La Ceiba | 0.35 | 5.00 |
| Bay Islands | 0.4 | *7.00 |
| Sta Rosa de Copán | 6.00 | - |
| Puerto Cortés | - | 4.00 |
Nota*: Incluidas las 2 horas de navegación.